Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ClmpQ8R373 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ClmpQ8R373 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms