Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OptnQ8K3K8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms