Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ncapd2Q8K2Z4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ncapd2Q8K2Z4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms