Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spire2Q8K1S6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Spire2Q8K1S6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms