Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nek9Q8K1R7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nek9Q8K1R7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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