Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sde2Q8K1J5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms