Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmbrd1Q8K0B2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbrd1Q8K0B2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms