Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc4a8Q8JZR6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc4a8Q8JZR6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms