Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LgsnQ8CIX8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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LgsnQ8CIX8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LgsnQ8CIX8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms