Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upp2Q8CGR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms