Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tcerg1Q8CGF7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcerg1Q8CGF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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