Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd1bQ8CFT2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd1bQ8CFT2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd1bQ8CFT2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setd1bQ8CFT2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Setd1bQ8CFT2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setd1bQ8CFT2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms