Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx8Q8CFD4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx8Q8CFD4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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