Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdkl1Q8CEQ0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms