Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc158Q8CDI6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc158Q8CDI6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms