Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CrebrfQ8CDG5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrebrfQ8CDG5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms