Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nhsl1Q8CAF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nhsl1Q8CAF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nhsl1Q8CAF4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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