Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spef2Q8C9J3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spef2Q8C9J3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spef2Q8C9J3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms