Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek11Q8C0Q4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek11Q8C0Q4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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