Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx16Q8C080 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Snx16Q8C080 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Snx16Q8C080 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Snx16Q8C080 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Snx16Q8C080 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx16Q8C080 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx16Q8C080 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms