Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc169Q8BXX9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc169Q8BXX9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms