Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx1bQ8BX32 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx1bQ8BX32 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms