Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube3dQ8BX13 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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