Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp40Q8BWR4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp40Q8BWR4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms