Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kdm4aQ8BW72 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms