Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Usp38Q8BW70 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp38Q8BW70 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Usp38Q8BW70 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Usp38Q8BW70 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp38Q8BW70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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