Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab3gap2Q8BMG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap2Q8BMG7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms