Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms