Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Htatsf1Q8BGC0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Htatsf1Q8BGC0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Htatsf1Q8BGC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms