Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pknox2Q8BG99 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pknox2Q8BG99 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms