Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srgap3Q812A2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srgap3Q812A2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms