Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfascQ810U3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfascQ810U3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms