Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Liat1Q810M6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Liat1Q810M6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Liat1Q810M6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms