Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg2bQ80XK6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg2bQ80XK6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg2bQ80XK6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms