Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube3cQ80U95 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3cQ80U95 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ube3cQ80U95 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms