Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cul9Q80TT8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul9Q80TT8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul9Q80TT8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms