Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna12Q80SS5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna12Q80SS5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms