Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ube2q1Q7TSS2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2q1Q7TSS2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms