Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccp110Q7TSH4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccp110Q7TSH4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms