Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc93Q7TQK5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc93Q7TQK5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc93Q7TQK5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms