Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ShprhQ7TPQ3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ShprhQ7TPQ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms