Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pkd1l2Q7TN88 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pkd1l2Q7TN88 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms