Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HhipQ7TN16 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HhipQ7TN16 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms