Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf2Q7TMI3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms