Protein–RNA interactions for Protein: Q7TM95

Tigd3, Tigger transposable element-derived protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd3Q7TM95 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tigd3Q7TM95 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tigd3Q7TM95 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms