Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brd2Q7JJ13 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd2Q7JJ13 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms