Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TwistnbQ78WZ7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TwistnbQ78WZ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms