Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rph3alQ768S4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rph3alQ768S4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms