Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sned1Q70E20 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sned1Q70E20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sned1Q70E20 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms