Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Syne2Q6ZWQ0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms